El Área de Fisicoquímica Teórica cultiva las siguientes Líneas de Investigación:

1. Estructura electrónica de superficies y simulación de imagenes de microscopía de tuneleo (STM).

2. Dinámica molecular ab-initio en moléculas.

3. Estructura electrónica de biomoléculas.

4. Mecanismos de reacción de moléculas orgánicas.

5. Reactividad química utilizando conceptos de la Teoría de Funcionales de la Densidad (TFD).

6. Desarrollo de nuevos funcionales para la TFD.

7. TFD a temperatura finita y en sistemas abiertos.

8. Mecánica cuántica de sistemas modelos.

9. Parametrización de campos de fuerza usando métodos ab-initio.